W maju 1993 roku podjęto działania zmierzające do wydzielenia ze struktur Wojewódzkiego Szpitala Zespolonego w Suwałkach Wojewódzkiej Poradni Rehabilitacji i utworzenia na jej bazie Ośrodka Rehabilitacji.
Wojewoda Suwalski na mocy Zarządzenia Nr 69/93 z dnia 16.06.1993 roku wydał zgodę na utworzenie publicznego zakładu opieki zdrowotnej pod nazwą Ośrodek Rehabilitacji w Suwałkach.
Ośrodek miał powstać w istniejącym już obiekcie przy ul. Waryńskiego 22A, a do czasu jego adaptacji siedzibą Ośrodka stały się dwa pawilony przy ul. Szkolnej 7 i 9.
W lipcu 1993 roku Ośrodek przejął również wydzielony ze struktur Szpitala Punkt Zaopatrzenia Ortopedycznego. Zgodnie ze Statutem Ośrodka funkcjonowały w tym czasie w Ośrodku poradnie rehabilitacji leczniczej dla dzieci i dorosłych, punkt zaopatrzenia ortopedycznego, działy: fizjoterapii i kinezyterapii oraz dział administracji i zarządzania.
Na początku października 1995 roku miało miejsce uroczyste otwarcie siedziby Ośrodka przy ul. Waryńskiego 22A, pierwszym Dyrektorem Zakładu została Pani Bożenna Nowacka.
W październiku 1996 roku rozpoczęto prace budowlane związane z budową nowego obiektu pod potrzeby stacjonarnego oddziału rehabilitacji leczniczej.
1 września 1997 roku decyzją Wojewody suwalskiego Ośrodek stał się samodzielnym publicznym zakładem opieki zdrowotnej.
We wrześniu 1999 roku przyjęto pierwszego pacjenta do nowo otwartego 30- łóżkowego Oddziału Rehabilitacji Leczniczej.
